Auteur : Julie

Trois nouveaux articles sur 1) la sélection génomique multicritère et la résistance au charançon chez l’épinette de Norvège (article complet ici), 2) l’impact des schéma de croisements sur la précision des modèles de sélection génomique chez l’épinette blanche (article complet ici) et 3) l’analyse coûts – bénéfices du déploiement de la sélection génomique dans les plantations du Québec (article complet ici).

Vidéo disponible ici

Un nouvel article sur le développement de la sélection génomique multicritère et de la sélection génomique pour améliorer la résistance au charançon chez l’épinette de Norvège. Voir l’article complet ici.

Azaiez, A., N. Pavy, S. Gérardi, J. Laroche, B. Boyle, F. Gagnon, M.-J. Mottet, J. Beaulieu & J. Bousquet. 2018. A catalog of annotated high-confidence SNPs from exome capture and sequencing reveals highly polymorphic genes in Norway spruce (Picea abies). BMC Genomics 19: 942 (13p.).

La sélection par la génomique vient de s’ajouter aux méthodes conventionnelles d’amélioration génétique. Cette technologie permet de déterminer dès leur plus jeune âge la valeur future de milliers d’individus issus de croisements par l’analyse des profils de leurs génomes, afin d’en orienter la sélection des meilleurs sujets. Les nouvelles variétés améliorées pourront ainsi être rendues disponibles beaucoup plus rapidement pour le reboisement. Plusieurs années de recherches ont permis de développer cette méthode et de la rendre déjà opérationnelle dans certains programmes d’amélioration génétique des épinettes au Québec et au Nouveau-Brunswick. Le projet FastTRAC a été le catalyseur de ce passage de la science à la pratique.

Une visite virtuelle vous permettra d’en apprendre davantage sur la production de plants d’épinette issus de la sélection par la génomique, ainsi que sur les gains obtenus à l’échelle opérationnelle et les recherches sous-jacentes à cette innovation.  Cette visite contient six stations panoramiques (images en mode 360 degrés permettant de se déplacer sur un plan horizontal et vertical), 35 vignettes (info-bulles) et 9 capsules vidéo. Débutez la visite virtuelle du projet FastTRAC ici.

19 au 23 août 2019, Lac Delage, Québec

Génétique forestière appliquée – où voulons-nous être en 2049?

www.acgf-cfga-conference.com

Les 18 et 19 octobre dernier, le projet FastTRAC tenait sa troisième réunion annuelle à Québec. Près d’une trentaine de chercheurs, partenaires et collaborateurs s’étaient donné rendez-vous pour discuter des progrès accomplis, pour répondre aux préoccupations des utilisateurs et s’assurer que le transfert de connaissances rencontre leurs besoins. Lors de la première journée, les résultats obtenus en vue de la mise en application de la sélection génomique dans les programmes d’amélioration génétique de l’épinette de Norvège et l’épinette blanche du Québec et du Nouveau-Brunswick ont d’abord été discutés en profondeur et des analyses complémentaires ont été identifiées en vue de répondre aux besoins spécifiques des partenaires. Par la suite, les résultats des analyses financières et économiques de divers scénarios d’utilisation du matériel génétique amélioré ont été discutés, faisant ressortir les bénéfices de la sélection génomique. Lors de la deuxième journée, les participants se sont donné rendez-vous dans un des tests génétiques d’épinette blanche du ministère des Forêts, de la Faune et de Parcs du Québec qui a été utilisé pour les recherches réalisées par le projet FastTRAC. Les participants ont ainsi pu poursuivre leurs échanges tout en pouvant constater la supériorité des arbres sélectionnés pour le programme avancé d’amélioration génétique de l’épinette blanche.

Le projet FastTRAC a organisé un atelier sur l’application de la sélection génomique aux programmes d’amélioration génétique des épinettes le 29 juin 2017 lors du congrès Forest Genetics 2017 de l’Association canadienne de génétique forestière (ACGF) et de la Western Forest Genetics Association (WFGA) à l’Université d’Alberta à Edmonton.

Les améliorateurs savent que la sélection génomique est déjà bien implantée dans des programmes d’amélioration des arbres, comme au Brésil. Désormais, il est maintenant possible de tirer parti d’exemples concrets d’applications de la sélection génomique pour faire progresser les programmes d’amélioration des arbres au Canada.

FastTRAC (Tests Rapides pour l’évaluation et l’Amélioration des Conifères) est un projet de trois ans financé par Génome Canada, Génome Québec et de multiples partenaires dans le cadre du Programme de partenariat en génomique appliquée (GAPP). Le projet FastTRAC représente une « preuve de concept » de l’application de la sélection génomique dans les programmes d’amélioration des épinettes de l’est du Canada, réunissant des scientifiques, des améliorateurs, des forestiers et des économistes. Les utilisateurs fournissent ainsi leurs propres ressources génétiques pour le développement et à l’utilisation de nouvelles méthodes basées sur la génomique. Les partenaires du projet utilisent les modèles FastTRAC de sélection génomique pour évaluer le potentiel de leurs arbres candidats à un âge très précoce afin d’accélérer le processus de sélection et de reboisement des stocks améliorés et adaptés.

L’objectif de l’atelier était d’exposer la dynamique du projet FastTRAC, son accent sur les gains génétiques de productivité et de résistance aux insectes par la sélection génomique chez l’épinette blanche et l’épinette de Norvège, l’engagement et le rôle des partenaires-utilisateurs, les bénéfices anticipés et les ressources génétiques nécessaires pour mener à bien l’application de la sélection génomique. Des scénarios économiques et financiers y ont également été présentés, incluant les résultats d’analyses coût-bénéfice dans un contexte de déploiement opérationnel et de sylviculture intensive, d’évaluation des gains en volume et en qualité du bois attendus, d’intégration de la sélection génomique dans les programmes d’amélioration conventionnels et d’embryogenèse somatique comme moyens de mise en oeuvre. La session a été conçue pour encourager les échanges entre les participants et les intervenants.

Programme

1:00 – 1:10 PM	Welcome remarks and workshop objectives – G. Smith
1:10 – 1:40 PM	The FastTRAC Project: Towards a cooperative approach for the implementation of genomic selection in conventional spruce breeding programs in Québec and the Maritimes J. Beaulieu, P. Lenz, S. Nadeau & J. Bousquet
1:40 – 2:00 PM	Discussion ·           What are the obstacles to apply GS in other tree breeding programs? –          Lack of suitable materials or trials for current power of GS approaches? –          Lack of genomic resources, genomic tools or analytical pipelines? –          Lack of expertise or financial resources for in-house development or application? –          Lack of external support for development or application? –          Lack of suitable delivery pipelines for production of selected material? ·           With GS, what might change in approaches to breeding and field testing?
2:00 – 2:25 PM	Financial and economic assessment of the implementation of GS in conventional tree breeding programs V. Chamberland, F. Robichaud, M. Perron, G. Smith, J. Beaulieu & J. Bousquet
2:25 – 2:50 PM	Discussion ·           What are the perceived factors influencing business decisions to integrate genomic selection and other genomic tools into tree breeding programs? ·           What are the perceived financial barriers to adoption? ·           How could they be overcome?
2:50 – 3:00 PM	Concluding remarks – G. Smith & J. Bousquet

Lenz, P.R.N., J. Beaulieu, S.D. Mansfield, S. Clément, M. Desponts & J. Bousquet. 2017. Factors affecting the accuracy of genomic selection for growth and wood quality traits in an advanced-breeding population of black spruce (Picea mariana). BMC Genomics 18: 335 (17p.).